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许多因素可以影响pcr的特异性，在此我们作一归纳，供大家参考：
1、退火步骤的严格性：提高退火温度可以减少不匹配的杂交，从而提高特异性。
2、减短退火时间及延伸时间可以减少错误引发及错误延伸。
3、引物二聚体是最常见的副产品，降低引物及酶的浓度也可以减少错误引发，尤其是引物的二聚化。
4、改变mgcl2(有时kcl)浓度可以改进特异性，这可能是提高反应严格性或者对taq酶的直接作用。
一般认为PCR产物应在48h以内完成电泳检测，有些最好于当日电泳检测，大于48h后带型就会出现不规则，甚至消失。
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